멀지 않은 미래, 유럽은 다민족으로 구성된 조직을 리더로 삼는다. 하지만 지배 세력을 교체하고자 하는 움직임이 생겨나고 비밀리에 개인 군부대가 운영되며 점차 계획적인 사건들이 발생하게 되는데... 이러한 움직임에 맞서게 된 인물들은 각각의 사연을 지닌 채 임무를 수행, 바로 이렇게 섹션 제로가 결성이 된다. 어둡고 잔인한 폭력적 군대와 부패한 정치 조직에 맞서, 우리가 알고 있던 세상의 영원한 소멸을 막고자 하는 섹션 제로의 위험한 미션이 시작된다!
